Klíčový rozdíl mezi alfa a beta anomery spočívá v tom, že v alfa anomeru je hydroxylová skupina na anomerním uhlíku cis k exocyklickému kyslíku v anomerním středu, zatímco v beta anomeru je hydroxylová skupina trans k exocyklickému kyslíku.
Anomer je geometrická variace mezi sacharidy. Je to typ epimeru, ve kterém můžeme vidět anomerní atom uhlíku. Anomerní atom uhlíku je odvozen od karbonylového uhlíku struktury s otevřeným řetězcem uhlohydrátu. Proto se tvorba cyklické struktury ze struktury s otevřeným řetězcem nazývá anomerizace.